馬鈴薯 Y 病毒屬(Potyvirus),,是一類嚴(yán)重影響植物生長(zhǎng)生產(chǎn)的植物病毒屬,,有數(shù)百個(gè)種,包括大豆花葉病毒(SMV),、三葉草黃脈病毒(CIYVV),、蕪菁花葉病毒(TuMV)deng 等。植物中的翻譯起始因子4E是對(duì)馬鈴薯Y病毒屬敏感的一個(gè)小家族,。當(dāng)作物中編碼eIF4E蛋白的天然抗性等位基因缺失時(shí),,敲除這些4E家族基因,可以賦予作物遺傳抗性,。eIF4E1是4E家族中一個(gè)對(duì)CIYVV敏感的翻譯起始因子,,本研究探討了利用敲除eIF4E1對(duì)擬南芥的病毒抗性的雙重影響.
研究結(jié)果表明,敲除eIF4E1后,,對(duì)CIYVV敏感的植株對(duì)三葉草黃脈病毒(ClYVV)表現(xiàn)出抗性,,但對(duì)蕪菁花葉病毒(TuMV)的敏感性顯著增強(qiáng),。而通過(guò)CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)構(gòu)建功能抗性等位基因eIF4E1可避免對(duì)TuMV的超敏反應(yīng),,同時(shí)保留對(duì)ClYVV的抗性。研究提示,,基因敲除策略可能因病毒利用其他同源因子而存在風(fēng)險(xiǎn),,而模擬天然抗性等位基因是更安全有效的策略。
FluorCam多光譜熒光成像系統(tǒng),除了具備葉綠素?zé)晒獬上?,可以檢測(cè)植物光合活性以外,,還具備多光譜熒光成像功能,比如FPs熒光蛋白成像,、UV-MCF紫外激發(fā)多光譜熒光成像等,。在這項(xiàng)研究中,F(xiàn)luorCam便承擔(dān)了檢測(cè)在病毒侵染下不同基因型擬南芥的衰老,、追蹤GFP標(biāo)記病毒分布及量化的雙重角色,。
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使用帶GFP標(biāo)記的TuMV(TuMV-GFP UK1)感染三個(gè)基因型的擬南芥,分別為野生型WT,;敲除eIF4E1對(duì)CIYVV具抗性的基因型(eif4e1KO),;敲除eIFiso4E對(duì)TuMV具抗性的基因型(eifiso4eKO)。使用FluorCam檢測(cè)感染14天,、21天之后擬南芥葉綠素?zé)晒庾兓ū碚魅~片衰老情況)及GFP表達(dá)情況(即TuMV病毒積累程度),。從結(jié)果可知,eifiso4eKO因其具備的病毒抗性,,而無(wú)明顯的病毒侵染,,性狀和葉綠素?zé)晒馑綗o(wú)明顯變化,而eif4e1KO的GFP信號(hào)更強(qiáng),,說(shuō)明其病毒積累更多,,葉綠素?zé)晒獬上窠Y(jié)果也顯示,其感染癥狀比野生型更為明顯,,表現(xiàn)為更嚴(yán)重早衰(葉綠素?zé)晒庀陆担?、新葉發(fā)育停滯。
野生型與兩個(gè)基因敲除擬南芥植株感染TuMV-GFP UK1病毒14天,、21天后的葉綠素?zé)晒?、GFP熒光蛋白成像結(jié)果
為了確認(rèn)eif4e1KO對(duì)TuMV易感是否由eIF4E1缺失有關(guān),,通過(guò)構(gòu)建了兩個(gè)互補(bǔ)系eif4e1KO;eIF4E1-1和eif4e1KO;eIF4E1-2,,在感染TuMV-GFP UK1后,于17天后,,分析了它們的表型,。FluorCam成像結(jié)果表明,eif4e1KO;eIF4E1-1和eif4e1KO;eIF4E1-2的病毒易感性表現(xiàn)恢復(fù)到了與野生型相似水平,,比eif4e1KO具有更高的TuMV抗性,,證明了eIF4E1的敲除缺失是eif4e1KO突變體易感性和病毒積累增加的唯一原因。
左圖:野生型與兩個(gè)互補(bǔ)恢復(fù)系植株感染病毒17天后的葉綠素?zé)晒?、GFP熒光蛋白成像結(jié)果,;
右圖:野生型與兩個(gè)基因編輯植株感染病毒17天后的葉綠素?zé)晒?、GFP熒光蛋白成像結(jié)果
研究中,模擬豌豆eIF4E等位基因中與抗馬鈴薯病毒屬相關(guān)的自然突變基因,,通過(guò)基因編輯的方法獲得非轉(zhuǎn)基因的eIF4E1N176K植株,,侵染實(shí)驗(yàn)的結(jié)果證明,該基因編輯株對(duì)TuMV無(wú)超敏反應(yīng),,且保留對(duì)ClYVV的抗性,。
結(jié)合研究中的其他實(shí)驗(yàn)結(jié)果,得出結(jié)論,,敲除eIF4E1雖賦予植株ClYVV的抗性,,但卻引發(fā)了對(duì)TuMV的過(guò)度敏感。CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)模擬天然抗性等位基因是更優(yōu)策略,,既可維持抗性,,又避免對(duì)其他病毒的易感性。研究強(qiáng)調(diào)基因敲除抗性育種存在潛在風(fēng)險(xiǎn),,而功能性等位基因編輯更具應(yīng)用前景,。
作為研究中的主要檢測(cè)手段,F(xiàn)luorCam提供了多方面的數(shù)據(jù)支撐,。葉綠素?zé)晒獬上窠Y(jié)果體現(xiàn)了葉綠素?zé)晒鈴?qiáng)度變化量化葉片衰老進(jìn)程,,直觀反映病毒感染引發(fā)的早衰現(xiàn)象,從而反映葉片衰老,。得力于系統(tǒng)非侵入性檢測(cè)的優(yōu)點(diǎn),,可以實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)追蹤植株生理狀態(tài),避免傳統(tǒng)取樣對(duì)實(shí)驗(yàn)的干擾和珍貴樣品的破壞,。而系統(tǒng)具備的GFP熒光蛋白檢測(cè)則為可視化病毒分布,、量化病毒積累提供、動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)感染不同階段病毒與宿主互作的時(shí)序性變化提供了可靠數(shù)據(jù),。FluorCam兼具的兩項(xiàng)技術(shù)共同為擬南芥抗病毒分子生物學(xué)研究提供了高效,、直觀的表型和分子水平分析工具。
參考文獻(xiàn):
Zafirov, Delyan, et al. "When a knockout is an Achilles’ heel: Resistance to one potyvirus species triggers hypersusceptibility to another one in Arabidopsis thaliana."Molecular Plant Pathology, 22.3 (2021): 334-347.
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