作為一門研究生物與自然環(huán)境相互關(guān)系的學(xué)科,,在生態(tài)學(xué)研究領(lǐng)域中,,植物與環(huán)境的相互關(guān)系一直是非常重要的研究方向,,具體研究?jī)?nèi)容包括而不限于:植物如何適應(yīng)自然環(huán)境尤其是在嚴(yán)苛的環(huán)境條件下是如何適應(yīng)與響應(yīng)的,;在特定生境下不同植物如何取得生態(tài)優(yōu)勢(shì)并競(jìng)爭(zhēng)生態(tài)位,;在全球溫室效應(yīng)背景下,,植物如何應(yīng)對(duì)逐漸升高的溫度,、大氣CO2濃度以及如何借助植物實(shí)現(xiàn)碳中和等等。
從21世紀(jì)10年代開始逐漸受到極大關(guān)注的表型phenotype,、表型組phenome,、表型組學(xué)phenomics概念則與生態(tài)學(xué)的相關(guān)概念不謀而合。現(xiàn)代表型概念也同樣強(qiáng)調(diào)環(huán)境對(duì)表型的影響。如今如火如荼的植物表型組學(xué)主要就是研究相同基因型的植物在不同的環(huán)境條件的表型變化與應(yīng)答,。
植物基因型,、表型與環(huán)境的關(guān)系(Walter,2015)
因此,,基于植物表型組學(xué)研究需求而在近十年中逐漸開發(fā)完善的植物表型成像技術(shù)也同樣可以用于與生態(tài)學(xué)研究領(lǐng)域,。各種植物表型成像技術(shù)在生態(tài)學(xué)領(lǐng)域的作用請(qǐng)見下表:
植物表型技術(shù) |
在生態(tài)學(xué)研究中的作用 |
RGB彩色成像技術(shù) |
快速測(cè)量株高、株寬,、葉面積等形態(tài)指標(biāo),,從形態(tài)角度評(píng)估植物生態(tài)適應(yīng)度 |
葉綠素?zé)晒獬上窦夹g(shù) |
無(wú)損快速檢測(cè)植物光能轉(zhuǎn)化效率、光合能力,、光合系統(tǒng)功能穩(wěn)定性以及受脅迫損傷程度等,,用于研究植物作為生產(chǎn)者的貢獻(xiàn)、生態(tài)競(jìng)爭(zhēng)優(yōu)勢(shì),、生態(tài)適應(yīng)及生態(tài)系統(tǒng)碳中和等 |
UV-MCF生物熒光成像技術(shù) |
通過(guò)次生代謝物熒光快速評(píng)估次生代謝水平,,評(píng)估植物逆境條件的生態(tài)適應(yīng)能力 |
紅外熱成像技術(shù) |
非接觸測(cè)葉片溫度,反映由于病害,、干旱等導(dǎo)致的葉片氣孔導(dǎo)度變化,、代謝紊亂等,可對(duì)植物葉片,、花朵,;整株植物;群落乃至整個(gè)生態(tài)系統(tǒng)進(jìn)行不同尺度的測(cè)量 |
高光譜成像技術(shù)(反射光譜) |
高光譜信息可反映植物健康,、色素組成,、水分與營(yíng)養(yǎng)狀況等生理生態(tài)信息,既可結(jié)合無(wú)人機(jī)對(duì)生態(tài)系統(tǒng)進(jìn)行快速植被覆蓋度,、多樣性與健康調(diào)查,也可在地面上對(duì)單株植物或樣方,、群落進(jìn)行精細(xì)調(diào)查,。 |
國(guó)內(nèi)外研究者利用易科泰及合作廠家提供的植物表型成像技術(shù)已經(jīng)取得了大量生態(tài)研究成果,下面我們介紹其中的部分重要成果:
案例一,、Who will win where and why? 牧草與入侵雜草的熱帶高山生態(tài)位競(jìng)爭(zhēng)
在熱帶農(nóng)業(yè)中,,蕨類植物經(jīng)常會(huì)入侵牧場(chǎng),與普通牧草競(jìng)爭(zhēng),。由于這種雜草的侵?jǐn)_,,人們經(jīng)常放棄原有牧場(chǎng),將熱帶森林開辟為新的放牧區(qū),,嚴(yán)重破壞生態(tài)系統(tǒng)生物多樣性,。
德國(guó)奧斯納布呂克大學(xué)對(duì)厄瓜多爾安第斯熱帶草原上的兩種主要競(jìng)爭(zhēng)植物——非洲狗尾草Setaria sphacelata和蕨類雜草Pteridium arachnoideum的生態(tài)競(jìng)爭(zhēng)進(jìn)行了研究。研究區(qū)衛(wèi)星數(shù)據(jù)顯示,隨著海拔高度的增加,,蕨類的競(jìng)爭(zhēng)力逐漸增強(qiáng),。隨著海拔的升高,兩種植物的生物量比重逐漸向蕨類植物傾斜,,在海拔1800 m以上,,蕨類的生長(zhǎng)能力超過(guò)了狗尾草。
左圖:在研究地點(diǎn)中蕨類對(duì)牧草的入侵,,紅色即為蕨類占優(yōu)勢(shì)的地區(qū),;右圖:在溫室中追加紫外光后狗尾草與蕨類的生長(zhǎng)差異
研究人員考慮海拔高度變化中,溫度和紫外光輻射是對(duì)植物生長(zhǎng)影響最大的兩個(gè)關(guān)鍵環(huán)境因素,。在進(jìn)一步的溫室試驗(yàn)中,,他們?cè)跍厥抑心M不同環(huán)境溫度并補(bǔ)充紫外光,同時(shí)用光合儀和FluorCam葉綠素?zé)晒獬上裣到y(tǒng)對(duì)在其中培養(yǎng)的狗尾草與蕨類光合作用進(jìn)行測(cè)量,。結(jié)果發(fā)現(xiàn),,狗尾草的凈光合速率要對(duì)低溫更敏感,而其光系統(tǒng)II最大光化學(xué)效率Fv/Fm在補(bǔ)充紫外光后顯著降低,,這說(shuō)明其光系統(tǒng)活性被紫外光嚴(yán)重抑制,。蕨類對(duì)溫度不敏感的光合作用及其對(duì)紫外線輻射的有效保護(hù)是其能夠在生態(tài)競(jìng)爭(zhēng)中獲得成功的原因。
左圖:不同環(huán)境溫度下狗尾草與蕨類的凈光合速率A,;中圖:補(bǔ)充UV對(duì)狗尾草與蕨類最大光化學(xué)效率Fv/Fm的影響,;右圖:溫室處理與不同海拔下狗尾草與蕨類的總黃酮含量(以蕓香苷標(biāo)定)和總多酚含量(以沒(méi)食子酸標(biāo)定)
再進(jìn)一步的葉片黃酮與多酚等次生代謝物含量測(cè)量,則解釋了這其中的機(jī)制,。黃酮類物質(zhì)可以吸收UV-A,、UV-B及藍(lán)光,從而有效屏蔽高能輻射對(duì)植物的損傷,。同時(shí)黃酮也是抗氧化劑和ROS清除劑,。結(jié)果發(fā)現(xiàn),在高海拔地區(qū),,蕨類合成了大量的黃酮與多酚物質(zhì),。而狗尾草的次生代謝水平則基本沒(méi)有變化。
由此研究人員得出結(jié)論,,由于在低溫下較差的光合能力和無(wú)法為葉片細(xì)胞提供足夠紫外線屏障,,使得狗尾草在這場(chǎng)高海拔生態(tài)位競(jìng)爭(zhēng)中敗下陣來(lái)。
在這個(gè)案例中,,研究人員使用了多臺(tái)儀器并通過(guò)較為復(fù)雜的色譜質(zhì)譜分析來(lái)測(cè)量次生代謝水平,。而現(xiàn)在的先進(jìn)技術(shù)已經(jīng)可以實(shí)現(xiàn)在一臺(tái)儀器上無(wú)損檢測(cè)植物葉綠素?zé)晒馀c次生代謝水平。FluorTron®多功能高光譜成像分析系統(tǒng)既可以通過(guò)多激發(fā)光葉綠素?zé)晒飧吖庾V成像分析來(lái)測(cè)量植物的光合能力與光系統(tǒng)狀態(tài),;也可以利用UV-MCF紫外光激發(fā)生物熒光高光譜成像技術(shù)來(lái)檢測(cè)植物黃酮,、多酚類物質(zhì)的次生代謝水平,;還可以進(jìn)行高光譜成像分析,在空間維度和光譜維度上對(duì)物體表面反射光信息成像,。所有這些成像功能均可對(duì)植物活體進(jìn)行無(wú)損測(cè)量,。
左圖:FluorTron®多功能高光譜成像分析系統(tǒng);右上圖:RGB成像(其中左側(cè)兩片葉片點(diǎn)滴過(guò)光合作用阻斷劑DCMU),、葉綠素?zé)晒鈪?shù)Fm’,、Fs、NPQ,;右下圖:銀杏葉黃酮醇(FLAV)高通量活體成像檢測(cè)(光照條件下葉片顯著高于陰影葉片,;EcoTech®實(shí)驗(yàn)室)
案例二、緯度策略,?北方與南方銀樺的生態(tài)適應(yīng)策略差異
在北方生長(zhǎng)的樹木會(huì)受到生長(zhǎng)期較短的限制,。那么它們的生態(tài)適應(yīng)策略又與生長(zhǎng)在南方的同類有什么差異呢?
東芬蘭大學(xué)將北方(北緯67°)與南方(北緯61°)銀樺(Betula pendula Roth)在同樣的生長(zhǎng)條件下進(jìn)行培養(yǎng),。結(jié)果表明兩者的總干重,、枝干重和根干重等沒(méi)有差異。而北方銀樺的葉干重更低,,同時(shí)具備更高的凈光合速率(凈CO2同化速率)Anet和更高的氣孔導(dǎo)度gs,,因此能達(dá)到與南方銀樺類似的總CO2同化速率。FluorCam葉綠素?zé)晒獬上窠Y(jié)果則表明,,北方銀樺具備更高的光系統(tǒng)II最大量子產(chǎn)額(最大光化學(xué)效率)Fv/Fm,。同時(shí),北方銀樺也具有更高的根生物量分?jǐn)?shù),。
由此,,研究人員確認(rèn),北方銀樺的高緯度生存策略:更高效的光合能力與更多投資地下生長(zhǎng),,使其更能適應(yīng)北極土壤,,有益于其在自然與人工擴(kuò)散過(guò)程中適應(yīng)新氣候。這一研究成果發(fā)表于2021年《Tree Physiology》,。
凈光合速率溫度響應(yīng)曲線,、氣孔導(dǎo)度溫度響應(yīng)曲線與凈光合速率光響應(yīng)曲線,紫線為北方銀樺,,黃線為南方銀樺
左圖:葉綠素?zé)晒獬上駭?shù)據(jù):最大光化學(xué)效率Fv/Fm、最小熒光Fo,、最大熒光Fm與可變熒光Fv,,右圖:葉生物量分?jǐn)?shù)LMF、枝生物量分?jǐn)?shù)SMF,、根生物量分?jǐn)?shù)RMF,、莖:根比率;紫色為北方銀樺,黃色為南方銀樺
本研究中根系及地上部生物量的測(cè)量仍采用的是取樣洗根,、干燥稱重的傳統(tǒng)方法,。這種方法較為準(zhǔn)確,但最大的問(wèn)題是無(wú)法對(duì)植物的生長(zhǎng)動(dòng)態(tài)進(jìn)行測(cè)量分析,。RhizoTron®植物根系多功能高光譜成像分析系統(tǒng)基于RhizoTron®根窗技術(shù),,實(shí)現(xiàn)根系表型的原位連續(xù)檢測(cè);可同時(shí)對(duì)根系和地上部幼苗進(jìn)行高光譜成像,、RGB成像,、UV-MCF紫外光激發(fā)生物熒光高光譜成像、Thermo-RGB成像等測(cè)量分析,;還可與LED培養(yǎng)系統(tǒng),、傳送系統(tǒng)結(jié)合,實(shí)現(xiàn)大樣品量的高通量自動(dòng)化連續(xù)監(jiān)測(cè),。
RhizoTron®植物根系多功能高光譜成像分析系統(tǒng)及根系原位成像圖
案例三,、溫室效應(yīng)背景下油菜的生理生態(tài)響應(yīng)
氣候條件會(huì)影響植物的許多表型性狀,包括生物化學(xué),、生理,、形態(tài)以及它們?cè)诘厍虻姆植肌D壳?,人類活?dòng)造成的溫室氣體排放使全球溫度上升,,并引起一系列的全球氣候變化。因此,,科學(xué)家需要預(yù)測(cè)在未來(lái)越發(fā)嚴(yán)峻的環(huán)境條件下,,植物如何進(jìn)行響應(yīng)和調(diào)節(jié),提前應(yīng)對(duì)可能發(fā)生的生態(tài)災(zāi)難,,并以此為基礎(chǔ)培育能夠應(yīng)對(duì)未來(lái)氣候條件的作物品種,。
西班牙國(guó)家研究委員會(huì)的Mónica Pineda與Matilde Barón合作,利用RGB成像,、UV-MCF多光譜熒光成像,、紅外熱成像、高光譜等無(wú)損植物表型成像技術(shù),,研究油菜在氣候變化條件下的生長(zhǎng)表型響應(yīng)與健康狀況,。他們模擬了三種不同溫度與CO2濃度的環(huán)境條件:
CCC:目前的氣候條件
RCP 4.5:基于IPCC報(bào)告推測(cè)的2081–2100年氣候條件(當(dāng)前政府的氣候變化應(yīng)對(duì)政策)
RCP 8.5:基于IPCC報(bào)告推測(cè)的2081–2100年氣候條件(不限制溫室氣體排放)
RGB彩色照片即可看到,在氣候變化條件下,,油菜葉片逐漸變色,、枯萎。多光譜熒光參數(shù)F440和F520升高,,代表次生代謝水平升高(植物次生代謝一般在應(yīng)對(duì)病害,、干旱等脅迫因素時(shí)才會(huì)顯著升高),。多光譜熒光比值參數(shù)F680/F740升高,代表葉綠素濃度降低,。紅外熱成像測(cè)量的修正葉溫TL-TA上升(葉溫減去氣溫),,代表其氣孔導(dǎo)度下降,蒸騰作用降低,,并且可能存在代謝紊亂,。后續(xù)研究進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),溫室效應(yīng)也會(huì)改變油菜黑腐病的發(fā)病狀況,。
左圖:RGB成像圖,;中圖:多光譜熒光成像圖與紅外熱成像圖;右圖:油菜黑腐病的多光譜熒光成像分析
基于高光譜成像技術(shù),,研究人員測(cè)量并計(jì)算了一系列與植物色素,、脅迫、活力,、光合相關(guān)的植被指數(shù),,如花青素指數(shù)ARI、類胡蘿卜素指數(shù)CRI,、生病花椰菜指數(shù)DBI,、歸一化植被指數(shù)NDVI和光化學(xué)反射指數(shù)PRI,并且根據(jù)研究結(jié)果提出了蕓薹屬氣候脅迫指數(shù)CSIB,。這些參數(shù)指標(biāo)分別與色素含量,、生物脅迫指示、活力,、光合作用相關(guān),。與其他植被指數(shù)相比,CSIB在實(shí)驗(yàn)處理25天時(shí)即可很好地區(qū)分三種不同處理的樣品,。進(jìn)一步的數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn),,CSIB與F520有較強(qiáng)的相關(guān)性,暗示CSIB代表的植物生理特性也是與次生代謝有關(guān)的,。
左:光譜指數(shù)數(shù)據(jù),,可見CSIB在區(qū)分不同環(huán)境條件處理樣品上表現(xiàn)最好;右:CSIB和F520的相關(guān)性分析
西班牙國(guó)家研究委員會(huì)這一系列研究使用的是FluorCam多光譜熒光成像系統(tǒng)為核心的模塊式植物表型成像系統(tǒng),。類似的研究工作更適于使用PhenoTron® PTS植物表型成像分析系統(tǒng),。這一系統(tǒng)采用PTS(Plant-To-Sensor)植物自動(dòng)傳送技術(shù),樣品依次自動(dòng)傳送至相應(yīng)成像工作站,,采集多傳感器表型成像大數(shù)據(jù),,實(shí)現(xiàn)一站式、高通量,、無(wú)損傷反射光成像,、葉綠素?zé)晒獬上瘛V-MCF多光譜熒光成像及紅外熱輻射成像分析等,。
左:西班牙國(guó)家研究委員會(huì)使用的FluorCam開放式多光譜成像系統(tǒng),;右:新型FluorCam 1300植物葉綠素?zé)晒馀c多光譜熒光成像系統(tǒng)
左:PhenoTron® PTS植物表型成像分析系統(tǒng);右:草銨膦對(duì)擬南芥光合生理影響(由EcoTech®實(shí)驗(yàn)室提供)
參考文獻(xiàn):
北京易科泰生態(tài)技術(shù)公司提供植物生態(tài)表型研究全面技術(shù)方案: