時間:2020-02-17
作者:易科泰
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簡介:
模塊式藻類表型成像分析系統(tǒng)
藻類是藍(lán)藻門,、眼蟲藻門、金藻門,、甲藻門,、綠藻門、褐藻門,、紅藻門等一系列水生生物的總稱,。其形態(tài)種類眾多,小至微米級的單細(xì)胞微藻,,大至長達(dá)幾米乃至幾十米的大型褐藻。藻類作為水體中最重要的初級生產(chǎn)者,,對整個生態(tài)系統(tǒng)乃至地球圈的穩(wěn)定都起著極為重要的作用,。同時,很多經(jīng)濟(jì)藻類也在食品,、醫(yī)藥,、能源等行業(yè)中扮演重要角色。而水華,、赤潮等有害生態(tài)現(xiàn)象也是由藻類造成的,。
在藻類研究中,需要全面分析藻類的表型特征,,尤其是光合生理,、形態(tài)、顏色,、色素組成與分布,、不同色素的光合貢獻(xiàn)、脅迫生理等方面的測量與分析,,使藻類表型數(shù)字化,、生理生態(tài)及功能可視化。這就需要針對藻類表型專門設(shè)計的表型成像系統(tǒng)方案,。
模塊式藻類表型成像分析系統(tǒng)由FMT150藻類培養(yǎng)與在線監(jiān)測單元,、FluorCam葉綠素?zé)晒饣蚨喙庾V熒光成像單元、FKM多光譜熒光動態(tài)顯微成像單元,、高光譜成像單元(或多光譜成像單元),、RGB彩色成像單元,、等組成,是目前市場上配置最靈活,、功能最全面,、性價比最高、技術(shù)領(lǐng)先的藻類表型與生理生態(tài)研究分析系統(tǒng),。
珊瑚共生體的表型成像研究,,左圖:珊瑚收縮-膨脹不同時相NDVI多光譜成像與GFP綠色熒光蛋白成像分析;右圖,;珊瑚表面及垂直剖面樣品分別在弱光和強(qiáng)光適應(yīng)條件下的RGB成像,、葉綠素?zé)晒獬上窈蚇DVI多光譜成像分析(Leal MC, et al. 2015)
主要功能特點(diǎn)與技術(shù)指標(biāo):
1. FMT150藻類培養(yǎng)與在線監(jiān)測技術(shù):將生物反應(yīng)器與監(jiān)測儀器獨(dú)特地結(jié)合在一起,用于淡水,、海水藻類和藍(lán)藻等的模塊化精確光照培養(yǎng)與生理監(jiān)測:
1) 尺寸容積可選:400ml,、1L、3L等,,可定制25L,、120L的大型培養(yǎng)容器
2) 全LED光源:紅光、藍(lán)光或白光,、紅光雙色光源,,其他光質(zhì)可定制,最大光強(qiáng)達(dá)3000μmol (photons).m-2.s-1
3) 精確控制溫度,、光強(qiáng),、培養(yǎng)周期、CO2濃度等培養(yǎng)條件,,模擬自然周期變化,,并可進(jìn)行恒化或恒濁培養(yǎng)
4) 在線實(shí)時監(jiān)測溫度、pH值,、溶解氧,、O2/CO2通量、營養(yǎng)鹽變化,、光密度,、葉綠素?zé)晒鈪?shù)(反映受脅迫狀況和生理狀態(tài))等多種環(huán)境與生理參數(shù)
5) 通過專用的電腦軟件實(shí)現(xiàn)外部控制、數(shù)據(jù)實(shí)時在線監(jiān)測和保存
6) 可選配MC1000 8通道藻類培養(yǎng)與在線監(jiān)測單元進(jìn)行快速重復(fù)培養(yǎng)實(shí)驗
萊茵衣藻多組學(xué)解析,,左圖:使用FMT150進(jìn)行精確控制培養(yǎng),;右圖:使用FluorCam進(jìn)行葉綠素?zé)晒夥治觯⊿trenkert, 2019, PNAS)
2. FluorCam葉綠素?zé)晒獬上窦夹g(shù):可根據(jù)需求選配不同型號和成像大小的葉綠素?zé)晒獬上裣到y(tǒng),或選配GFP/YFP等穩(wěn)態(tài)熒光成像,、PAR吸收/NDVI成像等:
1) 便攜式葉綠素?zé)晒獬上?,成像面積31.5x41.5mm,可用于野外及實(shí)驗室葉綠素?zé)晒獬上穹治?,還可選配光合聯(lián)用系統(tǒng)進(jìn)行光合作用測量和葉綠素?zé)晒獬上穹治鰷y量
2) 封閉式(一體式)葉綠素?zé)晒獬上裣到y(tǒng),,為功能最全(具備全部Protocols包括OJIP,、QA再氧化動力學(xué)等)、性價比最高,、使用最方便的臺式植物表型成像分析設(shè)備,,可同時對植物PAR吸收、光譜反射指數(shù)NDVI等進(jìn)行成像測量
3) FluorCam模塊式葉綠素?zé)晒獬上裣到y(tǒng),,有13x13cm標(biāo)準(zhǔn)版和20x20大型版,,模塊式結(jié)構(gòu),具備可擴(kuò)展性,,可選配白色LED光源(用于模擬自然光源),、青色LED光源、綠色LED光源,、紅色LED光源,、藍(lán)色LED光源等不同激發(fā)光源進(jìn)行光質(zhì)實(shí)驗,用于激發(fā)不同的藻類光合色素蛋白(下圖依次為便攜式,、一體式,、模塊式葉綠素?zé)晒獬上裣到y(tǒng))
4) FluorCam大型葉綠素?zé)晒獬上衿脚_,成像面積可達(dá)35x35cm(下圖依次為便攜式,、一體式,、模塊式葉綠素?zé)晒獬上裣到y(tǒng)和大型葉綠素?zé)晒獬上衿脚_)
5) FluorCam多光譜熒光成像技術(shù)方案,配備UV紫外光及專用濾波器激發(fā)并檢測藻類的多光譜熒光,,尤其適用于次生代謝組與病害表型研究。有一體式(成像面積13x13cm)或模塊式(成像面積13x13cm或20x20cm)供選配,,還可選配實(shí)驗室大型多光譜熒光成像平臺
中國海洋大學(xué)使用FluorCam多光譜熒光成像系統(tǒng)研究條斑紫菜Pyropia yezoensis感染赤腐病后的次生代謝響應(yīng)(Tang L, 2019)
3. FKM多光譜熒光動態(tài)顯微成像技術(shù):基于FluorCam葉綠素?zé)晒獬上窦夹g(shù)的顯微成像技術(shù),。它由包含可擴(kuò)展部件的增強(qiáng)顯微鏡、高分辨率CCD相機(jī),、激發(fā)光源組,、光譜儀、控溫模塊以及相應(yīng)的控制單元和專用的工作站與分析軟件組成,。它不僅可以對微藻,、單個細(xì)胞、單個葉綠體乃至基粒-基質(zhì)類囊體片段進(jìn)行葉綠素?zé)晒饧岸喙庾V熒光成像分析,,還可以進(jìn)行熒光蛋白,、熒光染料以及藻類特有光合色素的成像分析。
1) 內(nèi)置現(xiàn)今葉綠素?zé)晒庋芯康娜砍绦?,如Fv/Fm,、Kautsky誘導(dǎo)效應(yīng)、熒光淬滅,、OJIP快速熒光響應(yīng)曲線,、QA再氧化等,,可獲得70余項參數(shù)及其成像圖
2) 配備10倍、20倍,、40倍,、63倍和100倍專用生物熒光物鏡,可以清晰觀測到葉綠體及其發(fā)出的熒光
3) 激發(fā)光源組中包括紅外光,、紅光,、藍(lán)光、綠光,、白光,、紫外光和遠(yuǎn)紅光等,能夠研究植物/藻類中任何一種色素分子或發(fā)色團(tuán)
4) 可進(jìn)行GFP,、DAPI,、DiBAC4、SYTOX,、CTC等熒光蛋白,、熒光染料的成像分析
5) 高分辨率光譜儀能夠深入解析各種熒光的光譜圖。
6) 控溫系統(tǒng)可以保證實(shí)驗樣品在同等溫度條件下進(jìn)行測量,,提高實(shí)驗精度,,也可以進(jìn)行高溫/低溫脅迫研究。
魚腥藻異形胞分化過程中的光合作用規(guī)律(Ferimazova, 2014)
4. Specim高光譜成像技術(shù),,推薦IQ高光譜成像儀,,一體式設(shè)計,內(nèi)置自動推掃,、數(shù)據(jù)采集處理,、操作系統(tǒng)、觸摸屏及操作鍵,、GPS等,,機(jī)身小巧輕便,只有1.3kg,,實(shí)現(xiàn)輕松手持操作或固定操作,,波段范圍400-1000nm,7nm光譜分辨率,,204個波段,,圖像分辨率512x512像素,視野31度,,物距15cm至無窮遠(yuǎn),,1m視野55x55cm??蛇x配其它掃描式高光譜成像分析單元(參見下面高光譜成像技術(shù)選型參考表)
型號 |
FX10 |
PFD4k |
sCMOS |
FX17(nm) |
SWIR(nm) |
波段范圍 |
400-1000nm |
950-1700 |
1000-2500 |
||
光譜分辨率(FWHM) |
5.5nm |
3.0nm |
2.9nm |
8nm |
12nm |
波段 |
224 |
768 |
946 |
224 |
288 |
空間分辨率(像素) |
1024 |
1775 |
2184 |
640 |
384 |
光圈 |
F/1.7 |
F/2.4 |
F/2.4 |
F/1.7 |
F/2.0 |
信噪比 |
600:1 |
1000:1 |
1050:1 |
||
幀頻(fps) |
330 |
100 |
100 |
670 |
450 |
重量 |
1.26kg |
2.7kg |
>2.0kg |
1.56kg |
>14kg |
5. 可同時選配RGB成像分析或多光譜成像分析
6. 配置靈活、使用方便,可選配不同單元組合
海洋綠藻,、褐藻和紅藻的光譜成像分析(Ginneken V,,2017)