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— 生態(tài) · 農(nóng)業(yè) · 健康 —
易科泰(EcoTech)
PhenoTron? PTS植物表型成像分析系統(tǒng)

時間:2021-06-17

作者:易科泰

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簡介:


PhenoTron? PTS植物表型成像分析系統(tǒng),采用PTS(Plant-To-Sensor)植物自動傳送技術(shù),,集成高光譜成像技術(shù)及FluorCam葉綠素熒光成像,、多光譜熒光成像技術(shù),,可選配RGB成像及紅外熱成像,,樣品依次自動傳送至相應(yīng)成像工作站,采集多傳感器表型成像大數(shù)據(jù),,實現(xiàn)一站式,、高通量、無損傷反射光成像,、葉綠素熒光成像,、多光譜熒光成像及紅外熱輻射成像分析等。

微信截圖_20230128093311.png主要應(yīng)用于:

l 作物表型成像分析

l 種質(zhì)資源檢測

l 遺傳育種

l 抗性篩選

l 植物生理生態(tài)研究

l 藻類表型研究

l 光生物學研究

l 果實蔬菜品質(zhì)檢測

主要特點:

1)   PTS(Plant-to-Sensor)技術(shù)平臺,,SpectraScan?高精度專利移動掃描平臺,,樣品可放置在精準位移平臺上自動運送至成像單元進行一站式成像分析

2)   多傳感器成像,標配包括VNIR高光譜成像,、FluorCam葉綠素熒光成像,、多光譜熒光成像,可選配900-1700nm高光譜成像,、紅外熱成像,、Thermo-RGB?成像或高倍放大RGB成像(具備顯微成像功能)

3)   多激發(fā)光,調(diào)制多光譜光源板,,7位濾波輪等,,可實現(xiàn)植物及藻類不同光源培養(yǎng)光生物學研究、光合生理研究

4)   可選配葉綠素熒光高光譜成像分析,、UV-MCF高光譜活體熒光成像分析

5)   可對培養(yǎng)植株,、葉片、果實,、種子萌發(fā)與種苗,、根系及藻類等進行表型性狀成像檢測分析

6)   組合命令+位置記憶:可一鍵保存、讀取,、刪除當前位置,自動移動精準定位,,精度優(yōu)于1mm,,適用于周期性重復移動掃描,可設(shè)置10條protocols命令,,實現(xiàn)系統(tǒng)自動運行

7)   主機箱:全中文操作系統(tǒng),,PC端GUI軟件界面,可實現(xiàn)遠程操控,,內(nèi)置10寸觸控屏,,全波段對稱成像光源,0-100%線性調(diào)控,,角度,、高度可調(diào),,集開關(guān)控制、平臺控制,、雜散光隔離于一體,,確保光場均一、穩(wěn)定的最佳測量環(huán)境

8)   系統(tǒng)有效行程:Z軸高度400mm,,有效掃描面積大于1200×300mm

主要技術(shù)指標:

1)   葉綠素熒光成像:

a)   專業(yè)高靈敏度高分辨率葉綠素熒光成像CCD,,幀頻20fps,分辨率1360×1024像素,,binning2x2:680 x 512像素

b)   A/D轉(zhuǎn)換分辨率:16比特,、65536級灰階;像素大小6.45×6.45μm

c)   具快照模式和葉綠素熒光動態(tài)視頻模式

d)   標配617nm和6500K冷白雙色光化學光,,最大光化學光2000μmol.m-2. s-1,,可選配3000μmol.m-2. s-1

e)   飽和脈沖4000μmol.m-2. s-1,可選配6000μmol.m-2. s-1

f)   可選配365nm或385nm紫外光,、447nm品藍,、470nm藍色、530nm綠色,、505青色,、627nm紅色、660nm深紅,、590nm琥珀色,、740nm遠紅等不同光源

g)   可自動運行Fv/Fm、Kautsky誘導效應(yīng),、熒光淬滅分析,、光響應(yīng)曲線等protocols

h)   50多個葉綠素熒光自動測量分析參數(shù),包括:Fv/Fm,、Fv’/Fm’,、Y(II)、NPQ,、qN,、qP、Rfd,、ETR等,,自動形成葉綠素熒光參數(shù)圖

i)   自動同步顯示葉綠素熒光參數(shù)及參數(shù)圖、葉綠素熒光動態(tài)曲線,、葉綠素熒光參數(shù)頻率直方圖

2)   多光譜熒光成像:紫外光激發(fā)多光譜熒光成像,,反映多酚與黃酮類等次級代謝產(chǎn)物動態(tài)變化、葉綠素動態(tài)變化、植物衰老,、植物病蟲害脅迫及非生物脅迫等

a)   高分辨率CCD鏡頭,,1392x1040像素,有效像素大小為6.45μm,,可像素疊加(binning)以提高靈敏度(2x2,,3x3,4x4)

b)   7位濾波輪及濾波器,,用于測量多光譜熒光F440,、F520、F690,、F740及其它生物熒光現(xiàn)象及GFP等不同波段穩(wěn)態(tài)熒光成像

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3)   自動測量分析功能(無人值守):可預設(shè)1個或2個試驗程序,,系統(tǒng)可自動測量儲存,比如白天自動定時運行Kautsky誘導效應(yīng)程序,,夜間自動定時運行熒光淬滅分析程序

4)   可選配GFP/YFP等穩(wěn)態(tài)熒光成像,,或選配LUC熒光素酶成像

5)   葉綠素熒光成像與多光譜熒光成像具Live(實況測試)、Protocol(實驗程序選擇),、Pre-processing(成像預處理),、Result(成像分析結(jié)果)等菜單,Protocol實驗程序可自由編輯,,也可利用Protocol菜單中的向?qū)С绦蚰0婵蛻糇杂蓜?chuàng)建新的實驗程序

6)   高光譜成像站:標配為400-1000nm高光譜成像分析,,可選配900-1700nm或1000-2500nm

a)   波段數(shù):224通道

b)   光譜分辨率:FWHM 5.5nm

c)   空間分辨率:1024x

d)   數(shù)值孔徑:F/1.7

e)   可成像測量分析作物生化、生理指標如葉綠素含量,、花青素含量,、胡蘿卜素含量、光利用效率,、健康指數(shù),、覆蓋度、脅迫等近百種光譜指數(shù)

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由左到右依次為:小麥N素與水份狀態(tài)高光譜成像分析(Brooke Bruning等),;小麥耐鹽堿高光譜成像檢測(Ali Moghimi等,,2018);小麥鐮刀菌抗性檢測(E. Alisac等,,2018)

7)   紅外熱成像(選配):

a)   分辨率:640×512像素,,可選配其它高分辨率紅外熱成像傳感器

b)   測量溫度范圍:-25℃-150℃

c)   靈敏度:0.03℃(30mK)@30℃

d)   光譜范圍:7.5-13.5μm

e)   傳感器:非制冷紅外焦平面感應(yīng)器,已多點校準(具校準證書)

f)   1-14倍數(shù)碼變焦

g)   軟件具備調(diào)色板(自然,、彩虹、灰度,、梯度等14種顏色組合),、差值技術(shù)、溫度范圍設(shè)置(以改變顏色分布或突出選擇范圍等)、等溫線模式,、選區(qū)分析(點,、線、多邊形等),、溫度掃描(顯示所選線的溫度分布曲線等),、剖面溫度、時間圖等,;具備報告模式等,;

8)   RGB成像(選配):高靈敏度RGB成像,1-40倍放大,,可進行micro和macro成像分析,,可選配其它高分辨率成像傳感器

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易科泰工程師在中國海洋大學現(xiàn)場對培養(yǎng)的海帶進行高光譜成像分析和葉綠素熒光成像分析(右圖為紫菜多光譜熒光成像分析,引自:Lei Tang, Liping Qiu, Cong Liu, Guoying Du,Zhaolan Mo, Xianghai Tang,Yunxiang Mao.Transcriptonic Insights into Innate Imunity Responding to Red Rot Disease in Red Alga Pyropia yezoensis. Molecular Sciences,2019)

微信截圖_20230128093453.png

左圖為PhenoTron? PTS植物傳送至葉綠素熒光成像和高光譜成像站進行成像分析,;下右圖為草銨膦對擬南芥光合生理影響(葉綠素熒光成像分析,,由EcoTech?實驗室提供)

應(yīng)用案例:生菜幼苗病害快速無損檢測與抗性品種鑒定

農(nóng)作物在種子萌發(fā)生長過程中會遭遇各種病害,因此對高抗病性品種的選育非常重要,。而如果能快速,、無損、簡便,、可靠地檢測病害的發(fā)生,,甚至在病害癥狀發(fā)生前就能夠?qū)⑵錂z測到,無論是對于縮短育種周期還是指導生產(chǎn)實踐都具有非常重要的意義,。

德國萊布尼茨蔬菜和觀賞植物研究所IGZ的Sandmann研究組將剛發(fā)芽的生菜幼苗人工感染立枯絲核菌(Rhizoctonia solani),,然后綜合采用葉綠素熒光成像技術(shù)、多光譜熒光成像技術(shù),、紅外熱成像技術(shù)及植物反射光譜NDVI成像,,對不同成像參數(shù)進行了分析,以確定哪些技術(shù)的哪些參數(shù)能夠更靈敏地將感染病害的植株和未感染的植株區(qū)分開,,實現(xiàn)高通量非損傷在線分析測量篩選:

5.jpg 

結(jié)果發(fā)現(xiàn),,感染病害的植株和未感染的植株之間,最大光化學效率Fv/Fm,、熒光衰減指數(shù)Rfd,、NDVI、作物水脅迫指數(shù)I1,、光合有效葉面積日相對生長速率Arel,、多光譜熒光F440、F520等參數(shù)都表現(xiàn)出顯著差異,。通過進一步數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析最終發(fā)現(xiàn)Fv/Fm,、Rfd在本次實驗中的識別效果最好,,誤差≤0.052,F(xiàn)v/Fm>0.73的生菜幼苗即可認為是健康的,。研究人員希望通過進一步工作,,將這一發(fā)現(xiàn)應(yīng)用于園藝和農(nóng)業(yè)生產(chǎn)實踐,比如優(yōu)良抗病蔬菜品種的選育,、病害的早期發(fā)現(xiàn)與防治等,。

參考文獻:

1)Ali Moghimi etc. A Novel Approach to Assess Salt Stress Tolerance in Wheat Using Hyperspectral Imaging. Frontiers in Plant Science, 2018

2)   Brooke Bruning etc. The development of Hyperspectral distribution maps to predict the content and distribution of nitrogen and water in wheat. Frontiers in Plant Science, 2019

3)E.Alisaac etc. Hyperspectral quantification of wheat resistance to Fusarium head blight: comparison of two Fusarium species. Eur J Plant Pathol, 2018

4)   Sandmann M, et al. 2018. The use of features from fluorescence, thermography and NDVI imaging to detect biotic stress in lettuce. Plant Disease 102: 1101-1107

1101-1107

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