時(shí)間:2020-09-30
作者:易科泰
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簡介:
PlantScreen-SC植物表型分析測量系統(tǒng)(臺式)
PlantScreen-SC為高通量PlantScreen植物表型分析平臺的Mini版本(又稱Bench-top版即臺式),RGB成像,、葉綠素?zé)晒獾瘸上駛鞲衅髋渲迷谝粋€(gè)緊湊的箱體內(nèi),,通過人工(代替自動傳送帶)將植物樣品放置于箱體內(nèi)進(jìn)行成像分析,,具有結(jié)構(gòu)簡單、緊湊,,安裝使用方便(一般實(shí)驗(yàn)室或溫室都可安裝使用),、高性價(jià)比(省卻了昂貴復(fù)雜的傳送帶系統(tǒng)或XYZ三維移動機(jī)械臂系統(tǒng))、功能全面等優(yōu)點(diǎn),。
PlantScreen-SC植物表型成像分析平臺具備植物RGB可見光彩色3D成像分析技術(shù),、葉綠素?zé)晒饧夹g(shù)。適于實(shí)驗(yàn)室或溫室作物表型成像分析研究,,培養(yǎng)植物手動放入系統(tǒng)內(nèi)載樣臺上(手動載樣),,載樣臺可360度旋轉(zhuǎn)以便對植物不同角度成像分析??梢缘贸鲋参?、果實(shí)不同生育期的植株生長形態(tài)結(jié)構(gòu)參數(shù)、顏色分析,、生長發(fā)育及生理功能參數(shù),,如葉片形態(tài)測量、生長速率,、植物生長結(jié)構(gòu),、葉綠素?zé)晒狻⒐夂舷到y(tǒng)運(yùn)作機(jī)理、色素組成,、脅迫與抗性等,,實(shí)現(xiàn)快速、高效率,、無損傷測量檢測分析作物表型和生理生態(tài),,從而篩選出株行優(yōu)良和抗逆性強(qiáng)的株系材料,加速作物育種進(jìn)程,,是遺傳組學(xué),、表型組學(xué)、遺傳育種等研究的重要設(shè)備 ,。
主要功能特點(diǎn)如下:
1)RGB 3D成像分析:包括頂部和側(cè)面高分辨率彩色成像,,并配置有360°旋轉(zhuǎn)平臺,可對植物進(jìn)行三維立體形態(tài)結(jié)構(gòu)和顏色分析測量,,可用于植株,、果實(shí)、種子等形態(tài)結(jié)構(gòu)和顏色分析及生長發(fā)育分析,,包括大?。▽挾取㈤L度,、面積等等),、緊密度、對稱性(偏心度,、圓度,、質(zhì)心等參數(shù))、顏色分析(綠度指數(shù),、葉病斑,、果實(shí)成熟過程、真菌感染過程分析,、不同顏色面積比率等),。通過葉綠素?zé)晒獗O(jiān)測模塊,還可以進(jìn)一步測量分析植物的光合效率,、適合度、生物與非生物脅迫程度及敏感性,,以及植物的抗逆性(如抗病,、抗干旱等)等。
葉綠素?zé)晒獗O(jiān)測單元,,通過無人值守自動監(jiān)測即時(shí)葉綠素?zé)晒釬t,、光量子產(chǎn)量QY、Kautsky誘導(dǎo)效應(yīng),、熒光淬滅,、光響應(yīng)曲線,,及OJIP快速熒光動力學(xué)曲線等測量程序協(xié)議,監(jiān)測植物光合效率,、適合度,、光能利用效率、脅迫與抗性等生理性狀指標(biāo),,用于植物生理生態(tài)功能,、植物脅迫生理研究與抗性篩選。集成了PAM(脈沖調(diào)制技術(shù))熒光測量技術(shù)及OJIP快速熒光動力學(xué)測量技術(shù)等先進(jìn)葉綠素?zé)晒饧夹g(shù),??梢缘玫桨?F0 、Ft,、Fm,、Fm’、QY,、QY_Ln,、QY_Dn、NPQ,、Qp,、Rfd、PAR,、Area,、Mo、Sm,、PI,、ABS/RC 等50多個(gè)葉綠素?zé)晒鈪?shù)。
2)環(huán)境因子監(jiān)測,,同步監(jiān)測溫濕度與光合有效輻射等環(huán)境因子
3)PlantScreen表型大數(shù)據(jù)分析平臺
技術(shù)參數(shù):
1 主機(jī)系統(tǒng),;
1.1 智能LED冷白光源
1.2 內(nèi)置溫度、濕度及光強(qiáng)傳感器,,用于同步監(jiān)測環(huán)境因子
1.3 360度旋轉(zhuǎn)平臺
1.4 PlantScreen表型服務(wù)器,、PlantScreen 程序控制系統(tǒng)(Scheduler)
1.5 GUI(圖形用戶界面)實(shí)驗(yàn)設(shè)置與控制,實(shí)時(shí)顯示系統(tǒng)運(yùn)行狀態(tài)
1.6 支持多用戶注冊,,個(gè)性化實(shí)驗(yàn)計(jì)劃,、管理、存儲,、顯示,、分析
1.7 網(wǎng)絡(luò)化(Network):所有網(wǎng)絡(luò)組件符合1GBit標(biāo)準(zhǔn),主路由器提供系統(tǒng)內(nèi)網(wǎng)DHCP和路由服務(wù),還可與廠商服務(wù)器鏈接用于系統(tǒng)診斷,、軟件更新等
1.8 主機(jī)系統(tǒng)(Main computer):Ryzen 5 3600 處理器,,8GB RAM,256GB SSD 固態(tài)硬盤,,6TB RAID5 存儲,,Windows 7 Pro 操作系統(tǒng),配套顯示器,。
2 RGB 3D成像分析:
2.1 5MP CMOS RGB成像鏡頭,,傳感器尺寸1/2”
2.2 分辨率2560x1920像素,像素大小2.2μm,;幀頻:14fps@5MP
2.3 光學(xué)鏡頭:8mm SV0814H
2.4 成像高度可調(diào)以適應(yīng)不通高度植物
2.5 包括頂部和側(cè)面2個(gè)成像鏡頭和旋轉(zhuǎn)平臺(防治植物樣品),,可各個(gè)角度成像測量分析
2.6 可測量葉面積、周長,、寬度等形態(tài)測量和生長分析,,可進(jìn)行顏色分割分析等
3 葉綠素?zé)晒獗O(jiān)測:
3.1 集成了PAM(脈沖調(diào)制技術(shù))熒光測量技術(shù)及OJIP快速熒光動力學(xué)測量技術(shù)等先進(jìn)葉綠素?zé)晒饧夹g(shù)
3.2 Protocols:可自動運(yùn)行即時(shí)葉綠素?zé)晒釬t、光量子產(chǎn)量QY,、Kautsky誘導(dǎo)效應(yīng),、2套熒光淬滅、3 套光響應(yīng)曲線,,及 OJIP-test 等近10 種測量程序協(xié)議(protocols)
3.3 測量參數(shù)達(dá)50余個(gè),,其中OJIP-test在1秒時(shí)間內(nèi)測量記錄近多個(gè)葉綠素?zé)晒鈹?shù)據(jù)并通過軟件計(jì)算出包括 PI(Performance Index)等 26 個(gè)葉綠素?zé)晒鈪?shù)
3.3 測量光0-100%可調(diào),脈沖調(diào)制0.01 - 0.09 μmol.m-2.s-1 ,;光化光10 - 1000 μmol.m-2.s-1可調(diào),、飽和光脈沖10-100%可調(diào)(可達(dá)3,000 μmol.m-2.s-1)
3.4 數(shù)據(jù)通訊:USB或藍(lán)牙
3.5 具操作鍵和LC顯示屏
4 形態(tài)分析測量參數(shù):
4.1 葉面積(leaf area)
4.2 葉周長(leaf perimeter)
4.3 偏心度(Eccentricity)
4.4 圓度(roundness)
4.5 直徑(circle diameter)
4.6 平均葉寬指數(shù)(medium leaf width index)
4.7 緊密度(solidity/compactness)
4.8 凸包面積(convex hull area)
4.9 質(zhì)心(centroid)
4.10葉或果實(shí)長、寬等各種形態(tài)結(jié)構(gòu)參數(shù)
4.11 *時(shí)間序列分析以分析植物葉片果實(shí)生長率
4.12 整個(gè)生長期或?qū)嶒?yàn)期葉面積比較分析等
5 顏色分割分析測量
5.1綠度指數(shù)等
5.2不同顏色面積比率等
5.3 顏色分割以進(jìn)行植物適合度評估等
5.4葉片或果實(shí)顏色發(fā)育變化分析等,,如果實(shí)形態(tài)發(fā)育與顏色發(fā)育過程變化等
5.5顏色聚類分析
6 葉綠素?zé)晒鉁y量參數(shù)
6.1 測量參數(shù)包括F0,、Ft、Fm,、Fm’,、QY、QY_Ln,、QY_Dn,、NPQ、Qp,、Rfd,、PAR、Area,、Mo,、Sm、PI,、ABS/RC等50多個(gè)葉綠素?zé)晒鈪?shù),,及3種給光程序的光響應(yīng)曲線、2種熒光淬滅曲線,、OJIP曲線等
6.2.OJIP–test時(shí)間分辨率為10μs(每秒10萬次),,給出OJIP曲線和26個(gè)參數(shù),包括F0,、Fj,、Fi、Fm,、Fv,、Vj、Vi,、Fm/F0,、Fv/F0、Fv/Fm,、Mo,、Area、Fix Area,、Sm,、Ss、N,、Phi_Po,、Psi_o、Phi_Eo,、Phi–Do,、Phi_Pav、PI_Abs,、ABS/RC,、TRo/RC、ETo/RC,、DIo/RC等
6.3 內(nèi)置自動運(yùn)行protocols:Ft,、QY、OJIP,、NPQ1,、NPQ2、LC1,、LC2,、LC3等
6.4系統(tǒng)具備自動模式,、手動模式和服務(wù)器模式三種操作模式,自動模式自動運(yùn)行設(shè)定的程序,,數(shù)據(jù)自動處理并存入數(shù)據(jù)庫,;手動模式由人工啟動程序;服務(wù)器模式用于系統(tǒng)校準(zhǔn),、快照,、傳感器檢測、錯誤報(bào)告等
7 表型分析大數(shù)據(jù)平臺(服務(wù)器等)
7.1 表型分析系統(tǒng)(Plant DATA Analyzer),、應(yīng)用服務(wù)器,、數(shù)據(jù)庫等
7.2 在線可視化(visualization)顯示實(shí)驗(yàn)過程、結(jié)果等
組成:
主機(jī)箱,;表型分析大數(shù)據(jù)平臺,,包括系統(tǒng)控制通訊軟件包、數(shù)據(jù)分析,、服務(wù)器等,,用于系統(tǒng)控制、數(shù)據(jù)采集分析等,;三維RGB成像單元,,包括頂部和側(cè)面兩個(gè)RGB鏡頭、旋轉(zhuǎn)植物樣品擱架,;葉綠素?zé)晒鉁y量單元
產(chǎn)地:捷克